恐龙重返地球的几年后，地球资源越来越匮乏，邪恶的跨国集团将目光盯上了恐龙他们抢夺帕莫留下来的基因技术，秘密进行基因变异的研究，制造出了大量危险的变异恐龙并且妄图利用变异恐龙组成的军队控制全世界 随着变异恐龙作乱事件层出不穷，邪恶集团的阴谋渐渐浮出水面。以X26为代表的政府与邪恶集团展开了一场研究对决，新的技术和更强的装备不断出现，X26凭借这些和自身的超能力，不断与被改造的恐龙对决。 接着发生的，是在城市中蔓延开来的变异恐龙，它们肆意破坏暴动。X26成员和军队与恐龙展开了激烈的战斗，邪恶集团的阴谋被粉碎了。但让人始料未及的是，最后的战斗中，变异恐龙失控，它们攻击人类，并想占领整个地球。疯狂的攻击又开始了，人类不敌，被步步逼退，最后只能退居到一个小岛上坚守。人类陷入了严酷的生存危机。 大家想起了帕莫曾留给人类的神秘通讯器，也许只有帕莫才能解除人类的危机。人类决定进入太空，再度寻找帕莫……
